Bệnh viện Đa khoa khu vực Ngọc Hồi được thành lập ngày 13 tháng 6 năm 2008 theo Quyết định số 25/2008/QĐ-UBND của Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh Kon Tum. Trên nền tảng tách ra từ Trung tâm Y tế huyện Ngọc Hồi, thực hiện nhiệm vụ tuyến II khám bệnh, cấp cứu, điều trị cho dân cư các huyện Ngọc Hồi, Đăk Glei, Đăk Tô, Tu Mơ Rông, khu Kinh tế - Thương mại Cửa khẩu quốc tế Bờ Y và một số khu vực lân cận của 2 nước bạn Lào và Căm Pu Chia.
Khi mới thành lập và đi vào hoạt động Bệnh viện có 55 cán bộ viên chức (trong đó 10 Bác sĩ), cơ sở vật chất gồm 3 khối nhà do Dự án ADB xây dựng, chỉ tiêu được giao theo kế hoạch là 100 giường bệnh. Khi đó trang thiết bị thiếu thốn, trình độ cán bộ y tế còn thấp, chủ yếu là trình độ trung cấp. Trải qua 10 năm xây dựng và trưởng thành (giai đoạn 2008 – 2018). Đến nay Bệnh viện Đa khoa khu vực Ngọc Hồi đã không ngừng phát huy bản chất truyền thống của người Thầy thuốc xã hội chủ nghĩa, đoàn kết xây dựng Bệnh viện ngày càng lớn mạnh và hiện đại, thực hiện tốt nhiệm vụ khám, chữa bệnh, chăm sóc phục vụ sức khỏe nhân dân hiệu quả, chất lượng, là địa chỉ tin cậy cho người bệnh khi đến khám và điều trị, phục vụ nhiệm vụ chính trị trong sự nghiệp chăm sóc sức khỏe nhân dân các dân tộc khu vực phía Bắc tỉnh Kon Tum. Với thành tích 10 năm qua, Bệnh viện Đa khoa khu vực ngọc Hồi đã được tặng nhiều Bằng khen, Danh hiệu tập thể xuất sắc.
